A missão da FMV, consignada nos seus Estatutos é “a criação, transmissão e difusão da cultura, da ciência e da tecnologia na área das Ciências Veterinárias, através do desenvolvimento de actividades de educação, investigação e prestação de serviços de excelência, em benefício da sociedade.” É na concretização desta missão que se empenham diariamente docentes, funcionários e estudantes.