O restaurante foi fundado por um marinheiro, tripulante de uma nau que servia essencialmente para transportar mercadorias que provinham de outros portos, até ao século XV. Durante as suas viagens conheceu vários marinheiros onde aprendeu a arte culinária e durante anos foi transmitindo a sua sabedoria.
Fundou o restaurante com o nome As 3 Naus como homenagem ás viagens na era dos descobrimentos, e como símbolo de honra mandou colocar uma âncora de ferro fundido de grande dimensão mesmo em frente ao estabelecimento.
Por motivos de desgaste, cedeu a sua rota culinária a uma emigrante com bons conhecimentos da gastronomia portuguesa e francesa, o Sr. José Quintas.