Em Outubro de 1974 a Dr.ª Margarida Santiago inicia a sua carreira como Interna de policlinica no Centro Hospitalar de Coimbra após terminar a sua Licenciatura em Medicina, pela faculdade de Medicina da Universidade de Coimbra. Torna-se especialista de Neurologia em 1983 pelos HUC e esteve em Medicin Attaché Associé de Neurologia, nos Hospitais Civis de Strasbourg, França e em 1988 Fellowship em Neurofisiologia no The Johns Hopkins Hospital, Baltimore, U.S.A. Assim em 1989 torna-se a Fundadora do Laboratório de Electroencefalografia Drª Margarida Santiago e em 1995 fundadora do INN - Instituto de Neurologia e Neurofisiologia. Em 1987 inicia o estudo de uma grande especialidade, a doença do sono, sendo portadora neste momento de uma equipa especializada no tratamento desta doença.